2013年5月11日～12日，由清华大学化学系研究生工作组承办、岛津公司赞助的“清华大学第339期博士生论坛——两岸清华大学化学系博士生学术论坛暨岛津奖学金论文评审会”在三堡学术基地举行。来自北京清华大学与新竹清华大学的老师和博士研究生110余人参加了此次论坛。本次论坛根据报告相关性设立3个分会场，并安排博士生口头报告87场。

论坛开幕式于11日上午举行，由化学系党委副书记梁琼麟老师主持。北京清华大学化学系主任张希院士做了精彩报告，详细介绍了化学系的悠久历史、快速发展情况与培养人的理念等，新竹清华大学化学系黄贤达教授、岛津分析仪器事业部副部长曹磊博士分别致辞。随后刘磊教授（北京清华大学）、凌永健教授（新竹清华大学）、Dr. Yuki Hashi（岛津公司）分别做了精彩的大会报告。当天下午及次日上午进行了物化高分子、无机分析、有机三个分会场的博士生口头报告。两岸清华化学系老师们在报告会现场进行点评并与同学们深入交流。

化学系研工组组长郭勋老师主持了闭幕式；化学系副系主任李艳梅老师对本次论坛做了精彩总结，对论坛的成功举办表示祝贺，也对同学们未来的科研事业寄予了厚望；化学系副系主任分析中心主任林金明老师宣读了获奖名单，论坛通过投票共选出优秀报告25个（一等奖3个、二等奖6个，三等奖16个）。本次论坛不仅训练了博士生的表达能力，促进了学术争鸣，更为两岸师生的交流搭建了一个良好的平台。